วัดป่าคลองกุ้ง ตั้งอยู่เลขที่ ๓ ถ.ท่าแฉลบ ต.ตลาด อ.เมือง จ.จันทบุรี เป็นวัดในสายปฏิบัติกรรมฐานในพระอาจารย์มั่น ภูริทัตโต โดยมี “พระสุทธิธรรมรังสีคัมภีรเมธาจารย์” หรือ หลวงพ่อลี ธมฺมธโร วัดอโศการาม จ.สมุทรปราการ เป็น ผู้ก่อตั้งวัดป่าคลองกุ้ง โดยที่มาของการสร้างวัดป่าคลองกุ้งนั้น มีอยู่ว่า แต่เดิม วัดป่าคลองกุ้ง เป็นพื้นที่ป่าช้าในเขตพื้นที่บ้านคลองกุ้ง เริ่มแรกสถานที่แห่งนี้ได้รับคำแนะนำมาจากโยมอุปัฏฐากหลวงพ่อลี ได้แก่ หลวงอนุทัยธาดา นายอำเภอเมือง จ.จันทบุรีในขณะนั้น และ คุณนายหงส์ (ภริยา) , ขุนอำนาจอำนวยกิจ นายอำเภอกระโทกสมัยนั้น ( อ.โชคชัย) จ.นครราชสีมา คุณนายกิมลั๊ง (ภริยา)

ขณะเดียวกัน ในปี พ.ศ.๒๔๗๘ หลวงพ่อลีท่านได้ออกธุดงค์ในหลายจังหวัดและมีผ่านมายังตัวเมืองจันทบุรี จึงได้มีโอกาสเทศนาอบรมสั่งสอนญาติโยมให้ปฏิบัติกรรมฐาน ทำให้ชาวบ้านเลื่อมใสศรัทธา และนิมนต์ให้ท่านพำนักอยู่จำพรรษาที่วัดป่าคลองกุ้ง หลวงพ่อลี ท่านพิจารณาเห็นว่าต่อไปภายภาคหน้าวัดป่าคลองกุ้งจะเป็นอีกหนึ่งวัดที่มีประชาชนมาปฏิบัติกรรมฐานกันเป็นจำนวนมาก ท่านจึงรับนิมนต์จำพรรษาอยู่ที่นี่เพื่อโปรดญาติโยมโดยการสอนการปฏิบัติกรรมฐานให้แก่ญาติโยม เป็นเวลา ๑๔ พรรษา ตรงกับ ปี พ.ศ.๒๔๙๒

หลังจากนั้นหลวงพ่อลีจึงได้ธุดงควัตรไปยังประเทศอินเดียและกลับมาที่ประเทศไทยอีกครรั้ง กระทั่งได้สร้างวัดอโศการาม จ.สมุทรปราการขึ้น ในปี พ.ศ.๒๔๙๙ จากนั้นเป็นต้นมา ท่านจึงจำพรรษาที่วัดอโศการามจนถึงวันมรณภาพ เมื่อปี พ.ศ. ๒๕๐๔

อาจกล่าวได้ว่า วัดป่าคลองกุ้ง เป็นวัดที่หลวงพ่อลีสร้างและบุกเบิกมาก่อนวัดอโศการาม จึงเป็นสถานที่ที่สำคัญอย่างมากต่อหลวงพ่อลี สานุศิษย์ และประชาชนโดยทั่วไป ที่ต้องการฝึกปฏิบัติกรรมฐานในสถานที่สัปปายะ เนื่องจากหลวงพ่อลีได้สร้างวัดป่าคลองกุ้ง เพื่อใช้เป็นสถานที่ปฏิบัติกรรมฐานเป็นหลัก

ปัจจุบันวัดป่าคลองกุ้ง มีพระภาวนาปัญญาวิสุทธิ์ (พระมหาเข้ม จิตธมฺโม) ป.ธ.๓ เป็นเจ้าอาวาส โดยภายในวัดมีศูนย์พระพุทธศาสนาวันอาทิตย์วัดป่าคลองกุ้ง ศูนย์อบรมปฏิบัติธรรมวัดป่าคลองกุ้ง และศูนย์พัฒนาเด็กเล็กวัดป่าคลองกุ้ง